More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1657 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 
247 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  54.62 
 
 
258 aa  256  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  43.5 
 
 
264 aa  185  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  43.5 
 
 
264 aa  185  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  51.65 
 
 
282 aa  151  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.77 
 
 
302 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.32 
 
 
300 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.32 
 
 
300 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.19 
 
 
300 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.19 
 
 
300 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.19 
 
 
300 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.19 
 
 
300 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.19 
 
 
300 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.19 
 
 
300 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.19 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
300 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.78 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  48 
 
 
299 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.87 
 
 
318 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.73 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.54 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.54 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.67 
 
 
300 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.93 
 
 
313 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.44 
 
 
300 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.51 
 
 
313 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.3 
 
 
304 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.16 
 
 
313 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.44 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.38 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.44 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.44 
 
 
297 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.89 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.32 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
302 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.32 
 
 
308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.44 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.9 
 
 
317 aa  125  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.38 
 
 
307 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 
312 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.65 
 
 
316 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.52 
 
 
304 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
327 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.81 
 
 
317 aa  121  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.27 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.18 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.18 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.61 
 
 
287 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.7 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.25 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.06 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.64 
 
 
303 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.72 
 
 
312 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.49 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.89 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.69 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.71 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 
296 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.77 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.48 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.14 
 
 
286 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  37.44 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.48 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.45 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.45 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.99 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.24 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.03 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.26 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  36.21 
 
 
307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.48 
 
 
315 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
312 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.15 
 
 
299 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.05 
 
 
299 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
306 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.44 
 
 
296 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  30.81 
 
 
292 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.31 
 
 
293 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.44 
 
 
278 aa  106  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.38 
 
 
298 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2137  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.59 
 
 
337 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.85 
 
 
297 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.12 
 
 
299 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.87 
 
 
277 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.74 
 
 
506 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  31.58 
 
 
289 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.2 
 
 
277 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>