More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3447 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
300 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  60.27 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.99 
 
 
304 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.68 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.99 
 
 
300 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.99 
 
 
300 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.29 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.29 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.46 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.64 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.29 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.66 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.29 
 
 
300 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.68 
 
 
300 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.46 
 
 
297 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.64 
 
 
300 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.99 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.33 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.33 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.33 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.33 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.21 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.33 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.33 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.78 
 
 
298 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.89 
 
 
296 aa  298  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  53.04 
 
 
295 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.68 
 
 
506 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.99 
 
 
328 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.33 
 
 
297 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.33 
 
 
300 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.33 
 
 
296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.32 
 
 
294 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.98 
 
 
298 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.63 
 
 
307 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.03 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.03 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.33 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.81 
 
 
293 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.23 
 
 
301 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.95 
 
 
293 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.71 
 
 
295 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.22 
 
 
295 aa  228  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.37 
 
 
295 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.48 
 
 
293 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.16 
 
 
293 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  43 
 
 
294 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.28 
 
 
296 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.16 
 
 
293 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.16 
 
 
293 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.16 
 
 
293 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.16 
 
 
293 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.67 
 
 
293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.83 
 
 
293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  43 
 
 
293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.67 
 
 
293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.67 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.47 
 
 
293 aa  224  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.67 
 
 
295 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.05 
 
 
295 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4608  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.82 
 
 
292 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4871  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.82 
 
 
292 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.5 
 
 
293 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.47 
 
 
293 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.33 
 
 
295 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.04 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.14 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.48 
 
 
292 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4693  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.48 
 
 
292 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0617  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.48 
 
 
292 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00809563  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
293 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.54 
 
 
294 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4862  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.48 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.39 
 
 
299 aa  215  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4402  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.15 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0712  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.54 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.62 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3351  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.51 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.54 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3446  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.81 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  39.46 
 
 
311 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  43 
 
 
293 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.6 
 
 
292 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3554  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
293 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000257294  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03117  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.491501  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0137973  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3642  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000842217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.15 
 
 
292 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03068  hypothetical protein  45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3451  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000753069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4576  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000190936  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451998  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.33 
 
 
294 aa  203  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3681  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.33 
 
 
293 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.463059  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3574  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.33 
 
 
293 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00265065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3575  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.33 
 
 
293 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12838  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3646  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  decreased coverage  0.000138763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>