More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0208 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 		 506 aa  1028    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  87.77 
 
 		 328 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  59.03 
 
 		 300 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.71 
 
 		 300 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.71 
 
 		 300 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.06 
 
 		 300 aa  340  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.84 
 
 		 300 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.06 
 
 		 300 aa  339  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.74 
 
 		 300 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.42 
 
 		 300 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.42 
 
 		 300 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.06 
 
 		 300 aa  336  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.52 
 
 		 304 aa  325  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.05 
 
 		 302 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.05 
 
 		 300 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.05 
 
 		 300 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.05 
 
 		 300 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.05 
 
 		 300 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.05 
 
 		 300 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.05 
 
 		 300 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.05 
 
 		 300 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.72 
 
 		 297 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.37 
 
 		 298 aa  316  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.19 
 
 		 298 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.57 
 
 		 298 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 296 aa  279  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.86 
 
 		 296 aa  273  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.9 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.68 
 
 		 300 aa  252  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.85 
 
 		 300 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.67 
 
 		 294 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.93 
 
 		 295 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.93 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.56 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.79 
 
 		 296 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.07 
 
 		 297 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.07 
 
 		 297 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.02 
 
 		 293 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  43 
 
 		 293 aa  226  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.48 
 
 		 293 aa  226  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.72 
 
 		 293 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.53 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.53 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.53 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.35 
 
 		 293 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.02 
 
 		 293 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.69 
 
 		 293 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.37 
 
 		 293 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.18 
 
 		 293 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.21 
 
 		 293 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.29 
 
 		 296 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.32 
 
 		 294 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3351  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.23 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.08 
 
 		 290 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.51 
 
 		 293 aa  210  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.72 
 
 		 295 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3446  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.22 
 
 		 298 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.42 
 
 		 295 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 		 295 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.23 
 
 		 293 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 295 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.52 
 
 		 293 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.56 
 
 		 295 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.5 
 
 		 293 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.5 
 
 		 293 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.85 
 
 		 292 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.97 
 
 		 296 aa  203  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.5 
 
 		 306 aa  203  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.29 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.61 
 
 		 295 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.78 
 
 		 295 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.21 
 
 		 293 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.23 
 
 		 293 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  38.91 
 
 		 311 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  43 
 
 		 292 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.89 
 
 		 292 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.02 
 
 		 294 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.69 
 
 		 294 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.16 
 
 		 294 aa  193  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4608  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.12 
 
 		 292 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4871  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.12 
 
 		 292 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0617  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.35 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00809563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4693  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.48 
 
 		 292 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.41 
 
 		 303 aa  190  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4862  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.42 
 
 		 292 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.16 
 
 		 292 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4402  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.37 
 
 		 292 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.18 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0712  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.21 
 
 		 292 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.19 
 
 		 301 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3697  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.56 
 
 		 293 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.95 
 
 		 293 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03936  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.66 
 
 		 292 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.21 
 
 		 293 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.21 
 
 		 293 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0137973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3642  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.21 
 
 		 293 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000842217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>