More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1320 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  62.03 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.54 
 
 
308 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.91 
 
 
313 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.91 
 
 
313 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.77 
 
 
312 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
312 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.63 
 
 
315 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.49 
 
 
312 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.17 
 
 
312 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.49 
 
 
312 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.49 
 
 
312 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.49 
 
 
312 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.49 
 
 
312 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.17 
 
 
312 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
312 aa  245  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.93 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.53 
 
 
312 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.02 
 
 
333 aa  225  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.87 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  38.91 
 
 
307 aa  218  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.68 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.23 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.21 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.71 
 
 
307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.96 
 
 
317 aa  203  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.3 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.31 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.64 
 
 
303 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.84 
 
 
315 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.96 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.94 
 
 
312 aa  183  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.17 
 
 
315 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.58 
 
 
312 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.58 
 
 
312 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.13 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.76 
 
 
289 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 
315 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.46 
 
 
296 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.37 
 
 
306 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.61 
 
 
321 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.06 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3037  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 
341 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
309 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2137  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 
337 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.31 
 
 
316 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.43 
 
 
299 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0609  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.43 
 
 
280 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.03 
 
 
302 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.98 
 
 
298 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.43 
 
 
299 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.98 
 
 
286 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.04 
 
 
293 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.04 
 
 
293 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.04 
 
 
293 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.87 
 
 
293 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.25 
 
 
293 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 
293 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  27.51 
 
 
299 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 
293 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.11 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.11 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.41 
 
 
295 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  29.35 
 
 
292 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.11 
 
 
300 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.11 
 
 
300 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.11 
 
 
300 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.83 
 
 
293 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.11 
 
 
300 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.11 
 
 
300 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.27 
 
 
305 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.29 
 
 
277 aa  142  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  36.79 
 
 
284 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.16 
 
 
296 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.11 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.39 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.82 
 
 
293 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  39.49 
 
 
264 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.8 
 
 
293 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.67 
 
 
303 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.39 
 
 
277 aa  139  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.85 
 
 
296 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.4 
 
 
300 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.4 
 
 
295 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  39.49 
 
 
264 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.28 
 
 
287 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.28 
 
 
287 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.98 
 
 
287 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.23 
 
 
293 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>