More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2959 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
309 aa  620  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.52 
 
 
315 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  50.33 
 
 
299 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.59 
 
 
305 aa  292  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.37 
 
 
306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.37 
 
 
306 aa  288  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.49 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3080  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.81 
 
 
307 aa  221  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.78 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.39 
 
 
290 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.67 
 
 
327 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 
316 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.47 
 
 
313 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.08 
 
 
313 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.5 
 
 
321 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.07 
 
 
307 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.78 
 
 
304 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.7 
 
 
312 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.92 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.44 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
312 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
312 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
312 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
312 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
312 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.7 
 
 
312 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.55 
 
 
312 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.73 
 
 
308 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.11 
 
 
318 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.33 
 
 
287 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3037  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.61 
 
 
341 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.33 
 
 
287 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  47.8 
 
 
287 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.58 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.06 
 
 
315 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.25 
 
 
506 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.22 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  37.76 
 
 
307 aa  162  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.31 
 
 
312 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.12 
 
 
316 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.87 
 
 
296 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.86 
 
 
317 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.07 
 
 
295 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2137  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.05 
 
 
337 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.21 
 
 
293 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.21 
 
 
293 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.21 
 
 
293 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.53 
 
 
328 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  43.52 
 
 
284 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.21 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.63 
 
 
293 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  37 
 
 
286 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.53 
 
 
298 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.2 
 
 
302 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.54 
 
 
286 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.75 
 
 
317 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
296 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.1 
 
 
299 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.89 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.67 
 
 
292 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.55 
 
 
293 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.13 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.1 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.37 
 
 
298 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.06 
 
 
295 aa  152  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.33 
 
 
299 aa  152  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.37 
 
 
298 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.13 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.13 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.13 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.13 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.51 
 
 
289 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.13 
 
 
300 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.2 
 
 
304 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.13 
 
 
300 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 
300 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.95 
 
 
299 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 
317 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.81 
 
 
300 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.91 
 
 
300 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.91 
 
 
300 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.91 
 
 
300 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.18 
 
 
312 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.18 
 
 
312 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.01 
 
 
293 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.74 
 
 
294 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.91 
 
 
295 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.57 
 
 
289 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.03 
 
 
303 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.97 
 
 
293 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.28 
 
 
298 aa  148  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.97 
 
 
293 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.6 
 
 
295 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.97 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.45 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.33 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>