More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3109 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
321 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3037  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.89 
 
 
341 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2137  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.93 
 
 
337 aa  349  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.27 
 
 
327 aa  332  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.75 
 
 
315 aa  245  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.61 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.64 
 
 
316 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.42 
 
 
312 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.76 
 
 
306 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 
308 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.59 
 
 
312 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.82 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.56 
 
 
306 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.05 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.73 
 
 
315 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.5 
 
 
309 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
312 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.46 
 
 
313 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
313 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.97 
 
 
299 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.43 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.62 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.13 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.54 
 
 
299 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.76 
 
 
304 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.22 
 
 
307 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.33 
 
 
318 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.61 
 
 
313 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.54 
 
 
308 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3080  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 
307 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  30.63 
 
 
307 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.26 
 
 
299 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3969  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.72 
 
 
324 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272909  hitchhiker  0.00294439 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.53 
 
 
333 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
290 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0349  ribosomal L11 methyltransferase  33.23 
 
 
336 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.28 
 
 
303 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.1 
 
 
316 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.65 
 
 
300 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.93 
 
 
298 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.58 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.94 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.62 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.32 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.17 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.07 
 
 
317 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.98 
 
 
317 aa  142  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.21 
 
 
303 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.75 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.45 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.52 
 
 
296 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.09 
 
 
296 aa  139  8.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
298 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
289 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
294 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.9 
 
 
299 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.99 
 
 
300 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
298 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.99 
 
 
300 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.97 
 
 
293 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.57 
 
 
303 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.5 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  37.02 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.4 
 
 
328 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.68 
 
 
300 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.32 
 
 
289 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.24 
 
 
304 aa  136  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.44 
 
 
297 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.15 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.17 
 
 
304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.56 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.56 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.56 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.34 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.78 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.56 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  31.69 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.89 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0528  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.19 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0113889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.03 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.89 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4195  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.87 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.89 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.64 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.28 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.68 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.68 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.68 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.95 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>