More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3969 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3969  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  100 
 
 
324 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272909  hitchhiker  0.00294439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0349  ribosomal L11 methyltransferase  45.95 
 
 
336 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.87 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2137  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.01 
 
 
337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3037  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.07 
 
 
341 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.72 
 
 
321 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.12 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.79 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.82 
 
 
304 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.3 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.1 
 
 
312 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.53 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.89 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.89 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.19 
 
 
312 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.64 
 
 
312 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28.32 
 
 
318 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.19 
 
 
312 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.8 
 
 
302 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.6 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.6 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.6 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.6 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.6 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.6 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.75 
 
 
308 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.16 
 
 
312 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.85 
 
 
309 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.2 
 
 
312 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.19 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  33.02 
 
 
292 aa  99.4  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.97 
 
 
277 aa  99.4  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.51 
 
 
277 aa  99  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.46 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.46 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.46 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.95 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  24.78 
 
 
324 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.5 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.44 
 
 
278 aa  92.8  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  33.18 
 
 
253 aa  92.8  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.47 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.6 
 
 
299 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  92  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.08 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.97 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.82 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0488  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.72 
 
 
301 aa  89.7  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.56 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 
303 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.45 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.44 
 
 
313 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  30.73 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  31.25 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17811  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.84 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.578713  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  32.12 
 
 
247 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.11 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.05 
 
 
303 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  32.21 
 
 
198 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.45 
 
 
299 aa  87  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  29.63 
 
 
285 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 
293 aa  85.9  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  25 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  26.37 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  33.03 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.84 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0528  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.49 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0113889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  33.01 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.19 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.52 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  32.86 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.15 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0609  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.86 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.58 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  31.19 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.52 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.36 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.39 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  33.47 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.92 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.49 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.18 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  29.82 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.5 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.64 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  28.64 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.41 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28.97 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  29.24 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.64 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.61 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.51 
 
 
298 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.98 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.96 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.58 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.12 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  30.05 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.22 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>