More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0528 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0528  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0113889  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2149  ribosomal protein L11 methyltransferase  77.55 
 
 
295 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.57 
 
 
301 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17811  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.56 
 
 
311 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.578713  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.87 
 
 
311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.44 
 
 
305 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.51 
 
 
299 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.93 
 
 
300 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.33 
 
 
296 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.33 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.09 
 
 
306 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.73 
 
 
298 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.27 
 
 
303 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.26 
 
 
303 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4195  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.36 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3376  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.28 
 
 
295 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2157  50S ribosomal protein L11 methyltransferase  36.48 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15541  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.26 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.730327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.95 
 
 
294 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.28 
 
 
317 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  34.38 
 
 
307 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.35 
 
 
296 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.45 
 
 
315 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 
308 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.13 
 
 
315 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.32 
 
 
312 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.19 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.25 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  44.09 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.53 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.87 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.2 
 
 
319 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.63 
 
 
306 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.3 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.3 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.38 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3037  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.9 
 
 
341 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.18 
 
 
312 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.62 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.62 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.62 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.01 
 
 
315 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.57 
 
 
306 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.42 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.21 
 
 
283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.58 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.81 
 
 
292 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.67 
 
 
295 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
289 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.04 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.06 
 
 
316 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.01 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.91 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.82 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.22 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.49 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.91 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.9 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.92 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.55 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.91 
 
 
313 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.49 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  31.49 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.01 
 
 
312 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.01 
 
 
312 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.67 
 
 
295 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 
303 aa  125  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 
312 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 
312 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.92 
 
 
316 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 
312 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 
312 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 
312 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 
312 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.01 
 
 
305 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.24 
 
 
300 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.06 
 
 
304 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2137  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.24 
 
 
337 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 
300 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.86 
 
 
293 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  37.21 
 
 
286 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.5 
 
 
299 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.21 
 
 
293 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.89 
 
 
300 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.89 
 
 
300 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.56 
 
 
293 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.72 
 
 
327 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.89 
 
 
300 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.8 
 
 
295 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.52 
 
 
299 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
293 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.56 
 
 
293 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.56 
 
 
293 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.2 
 
 
304 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.45 
 
 
300 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.56 
 
 
293 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>