More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3320 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  79.19 
 
 
214 aa  321  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1381  ribosomal L11 methyltransferase  58.38 
 
 
198 aa  211  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.37 
 
 
306 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.21 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.74 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.42 
 
 
306 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  38.27 
 
 
285 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
312 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.14 
 
 
294 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.91 
 
 
293 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.24 
 
 
296 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
321 aa  98.6  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.82 
 
 
312 aa  98.2  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.14 
 
 
294 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.23 
 
 
298 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.36 
 
 
299 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.85 
 
 
283 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.4 
 
 
277 aa  95.9  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 
312 aa  95.5  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 
312 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.36 
 
 
290 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 
299 aa  95.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  34.16 
 
 
284 aa  94.4  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 
312 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 
312 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 
312 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 
312 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 
312 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.78 
 
 
275 aa  94  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 
312 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
298 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 
292 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.17 
 
 
312 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.32 
 
 
290 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.17 
 
 
312 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.17 
 
 
312 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
298 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.15 
 
 
296 aa  92.8  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  37.14 
 
 
310 aa  92.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.5 
 
 
315 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
315 aa  92.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.08 
 
 
287 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.63 
 
 
275 aa  91.7  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  37.27 
 
 
264 aa  91.3  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 
296 aa  91.3  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3151  ribosomal L11 methyltransferase  41.21 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.917593  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1674  ribosomal L11 methyltransferase  36.95 
 
 
295 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
295 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.46 
 
 
290 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  37.27 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.95 
 
 
315 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.85 
 
 
307 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  37.35 
 
 
292 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.59 
 
 
305 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1487  ribosomal L11 methyltransferase  42.33 
 
 
285 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000855878  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.48 
 
 
277 aa  90.1  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
295 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.51 
 
 
506 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.27 
 
 
304 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 
305 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
287 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.88 
 
 
295 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
287 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.75 
 
 
290 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.04 
 
 
293 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 
327 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.61 
 
 
299 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  40.37 
 
 
253 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.62 
 
 
304 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.14 
 
 
291 aa  88.2  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  34.65 
 
 
296 aa  88.2  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.51 
 
 
318 aa  87.8  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0096  ribosomal L11 methyltransferase  42.86 
 
 
303 aa  87.8  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.76 
 
 
278 aa  87.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.82 
 
 
289 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.95 
 
 
313 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.87 
 
 
296 aa  87.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.04 
 
 
308 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.48 
 
 
281 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.17 
 
 
308 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3969  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.21 
 
 
324 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272909  hitchhiker  0.00294439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.61 
 
 
289 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.86 
 
 
292 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.57 
 
 
293 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.48 
 
 
281 aa  85.9  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.48 
 
 
282 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
313 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.11 
 
 
301 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.26 
 
 
293 aa  85.9  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.68 
 
 
296 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 
328 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
294 aa  85.5  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.86 
 
 
292 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.63 
 
 
299 aa  85.5  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.75 
 
 
297 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.15 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.01 
 
 
298 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.25 
 
 
303 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>