More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0604 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
282 aa  568  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  97.86 
 
 
281 aa  554  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  97.86 
 
 
281 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.64 
 
 
278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.14 
 
 
277 aa  288  6e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
277 aa  275  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.76 
 
 
275 aa  259  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.09 
 
 
275 aa  227  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0488  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.05 
 
 
301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.57 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.67 
 
 
304 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  31.85 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  32.68 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.06 
 
 
316 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.27 
 
 
333 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.5 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  35 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  30.58 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.61 
 
 
297 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.17 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  32.21 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.61 
 
 
297 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.43 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.26 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  30.14 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 
289 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.64 
 
 
298 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.15 
 
 
313 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.15 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  29.77 
 
 
310 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.38 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.09 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  34.48 
 
 
247 aa  112  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.97 
 
 
297 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.24 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.65 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  26.77 
 
 
253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.5 
 
 
312 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.55 
 
 
301 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
308 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  32.86 
 
 
284 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.23 
 
 
306 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.57 
 
 
300 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  29.76 
 
 
296 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.96 
 
 
298 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.11 
 
 
285 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.65 
 
 
295 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.64 
 
 
312 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.18 
 
 
295 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
294 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  29.07 
 
 
276 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  32.85 
 
 
282 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  29 
 
 
298 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28.72 
 
 
287 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  29.67 
 
 
296 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.57 
 
 
286 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.51 
 
 
309 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.96 
 
 
298 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.42 
 
 
287 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.26 
 
 
304 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.42 
 
 
287 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.55 
 
 
315 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.46 
 
 
298 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.72 
 
 
297 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  26.55 
 
 
275 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.88 
 
 
307 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.19 
 
 
304 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.5 
 
 
308 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.94 
 
 
298 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.26 
 
 
295 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  29.19 
 
 
295 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.94 
 
 
299 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.76 
 
 
328 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  28.96 
 
 
296 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 
296 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.67 
 
 
300 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.73 
 
 
296 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.12 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.73 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.68 
 
 
278 aa  99  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.9 
 
 
293 aa  99  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.77 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  30.66 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.6 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.83 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3969  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.46 
 
 
324 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272909  hitchhiker  0.00294439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  27.05 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.72 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.99 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>