More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0776 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  56.52 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  51.05 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  50.34 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  53.08 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  49.32 
 
 		 305 aa  251  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  48.95 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  48.6 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  49.32 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  51.7 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  49.3 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  47.22 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  48.25 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  48.95 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  51.88 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  43.39 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.58 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.69 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.91 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  46.4 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.39 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.96 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.75 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.72 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.58 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  40.53 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  43.8 
 
 		 291 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.8 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.29 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  47.34 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.06 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  43.02 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  43.13 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  38.76 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.76 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.25 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  42.52 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.01 
 
 		 506 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.51 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.97 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.09 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.51 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.25 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.88 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.55 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.99 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.14 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.65 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.9 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.1 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.8 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.67 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.76 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.29 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.96 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.81 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.07 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  38.03 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.32 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.89 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.32 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.03 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.18 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.69 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.03 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.64 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.74 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.99 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  37.38 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.03 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.3 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.32 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.6 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.6 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.7 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.6 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.04 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.96 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.82 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.24 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.24 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.24 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.3 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.79 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.24 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>