More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2866 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  100 
 
 		 297 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  45.23 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  39.29 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  39.78 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  43.36 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  42.13 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  38.58 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  38.04 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  40.22 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.71 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  38.52 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  40.67 
 
 		 306 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.99 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  43.29 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  36.3 
 
 		 321 aa  168  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  36.57 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  35.94 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  36.57 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  40.78 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.82 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.36 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.54 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.19 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  37.74 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.54 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.58 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.82 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  37.84 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.3 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.61 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  38.81 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  38.4 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  35.25 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.25 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.99 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  41.95 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  34.87 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  38.06 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.87 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.57 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.09 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.8 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.8 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.09 
 
 		 506 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.24 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.73 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.4 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.4 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.4 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.36 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.67 
 
 		 294 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.56 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.8 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.78 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.8 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.79 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.21 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.6 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.56 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.86 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.61 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.89 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.06 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.06 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.85 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.85 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.85 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.7 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.85 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.2 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.2 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.75 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.05 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.85 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.44 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.7 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.2 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.65 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.38 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.52 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.84 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  31 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.2 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.92 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.6 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.98 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.03 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.17 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.83 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.83 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.83 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>