More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0217 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 		 305 aa  598  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  55.33 
 
 		 301 aa  295  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.36 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  40.58 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  39.38 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  40.62 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  45.15 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.54 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  46.79 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  46.26 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  44.69 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  44.59 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.96 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.06 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.77 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  38.82 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  43.41 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.4 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.5 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  42.79 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.72 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.33 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.2 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  39.85 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.46 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  40.07 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  39.46 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  37.63 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  40.28 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  38.49 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  36.92 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.85 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.6 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  39.03 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  39.03 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.09 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.74 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.5 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.82 
 
 		 506 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.26 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.55 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  37.46 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.55 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.9 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.09 
 
 		 287 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.4 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.55 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.61 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  35.61 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.2 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.21 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  41.55 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.39 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.12 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.27 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  39.27 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  38.53 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.47 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.63 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.2 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.11 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.22 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  42.56 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3080  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.74 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.46 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.28 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.22 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.21 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.1 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.36 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.51 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.83 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.75 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.97 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.75 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.97 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.32 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.38 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.5 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.76 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.44 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.49 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.48 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.44 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.27 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.88 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.79 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.56 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.44 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.48 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.11 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>