More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2210 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  99.66 
 
 		 291 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  93.79 
 
 		 291 aa  507  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  68.28 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  65.4 
 
 		 289 aa  357  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  63.1 
 
 		 290 aa  357  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  65.86 
 
 		 289 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  45.26 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  44 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.51 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  44.18 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.91 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.91 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  43.66 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  44.52 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.64 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.86 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  42.4 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  41.64 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  41.98 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.69 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.21 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  44.68 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  41.84 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  41.84 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.91 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  41.31 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.92 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  42.42 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.49 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.57 
 
 		 286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  42.6 
 
 		 306 aa  171  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  42.71 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  44.52 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  39.79 
 
 		 305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.25 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  38.33 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  38.27 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  40.91 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.38 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  38.66 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.53 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.82 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.53 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.88 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.01 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.09 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  35.91 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.95 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.04 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 506 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.21 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.04 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.6 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.82 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  33.97 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.6 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.92 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  39.07 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.79 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.4 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.43 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.73 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.11 
 
 		 313 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.16 
 
 		 312 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.35 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.86 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.86 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.86 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.86 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.86 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.67 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.86 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.02 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.2 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.82 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.48 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.55 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.15 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.43 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3376  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.64 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.54 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.83 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.65 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>