More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0961 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  100 
 
 
290 aa  577  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  68.51 
 
 
289 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  67.6 
 
 
289 aa  362  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  63.1 
 
 
291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  63.1 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  63.1 
 
 
291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  63.19 
 
 
289 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  45.16 
 
 
310 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.1 
 
 
298 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 
285 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  48 
 
 
296 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  45.64 
 
 
323 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  44.98 
 
 
321 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  47.51 
 
 
295 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  45.02 
 
 
298 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  46.3 
 
 
296 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
290 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  47.15 
 
 
298 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.19 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  43.85 
 
 
296 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  42.51 
 
 
305 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.15 
 
 
292 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.35 
 
 
290 aa  188  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  40.21 
 
 
305 aa  188  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  42.16 
 
 
305 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.58 
 
 
292 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  43.64 
 
 
306 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.75 
 
 
297 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  43.66 
 
 
310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.38 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  42.58 
 
 
300 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  41.96 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.12 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  41.32 
 
 
306 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.99 
 
 
297 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  43.66 
 
 
309 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  44.33 
 
 
305 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  43.61 
 
 
308 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  36.55 
 
 
301 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.72 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.91 
 
 
286 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  39.45 
 
 
284 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.29 
 
 
287 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.38 
 
 
287 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.38 
 
 
287 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.77 
 
 
315 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.79 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.22 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 
506 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.23 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  41.44 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.2 
 
 
303 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.02 
 
 
293 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.02 
 
 
293 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  32.18 
 
 
311 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  35.56 
 
 
253 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.18 
 
 
283 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.09 
 
 
299 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.6 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.48 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  40.52 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.07 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.6 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.74 
 
 
293 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.07 
 
 
293 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.6 
 
 
293 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.6 
 
 
293 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.6 
 
 
293 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.84 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.91 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.84 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.33 
 
 
300 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.27 
 
 
300 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.27 
 
 
300 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.33 
 
 
300 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.91 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.12 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.57 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.28 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.96 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.87 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.82 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.32 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.19 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.94 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  40.19 
 
 
283 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.74 
 
 
295 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.57 
 
 
300 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.12 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
304 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.16 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.89 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.68 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.38 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.5 
 
 
300 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 
308 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.96 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>