More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2367 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 		 321 aa  634    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  85.81 
 
 		 298 aa  511  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  68.04 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  66.89 
 
 		 298 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  67.13 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  66.43 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  66.55 
 
 		 295 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  53.66 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  51.05 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  48.59 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  51.96 
 
 		 306 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  47.89 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  50.35 
 
 		 310 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  47.54 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.56 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  47.3 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.72 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.88 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.15 
 
 		 298 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.04 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.29 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  51.06 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  48.02 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.98 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  45.72 
 
 		 291 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.76 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  46.48 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.52 
 
 		 291 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  45.52 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.63 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.94 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  42.54 
 
 		 289 aa  192  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  41.06 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  40.62 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.31 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.3 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  41.89 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.62 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  44.55 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.14 
 
 		 506 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.24 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.77 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.09 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.19 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.32 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.14 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.14 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.14 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.14 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.47 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.63 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.63 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.63 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.4 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.22 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  39.45 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.57 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  37.82 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.41 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.92 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  38.7 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.2 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.2 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.84 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 		 300 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.2 
 
 		 300 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.42 
 
 		 300 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.45 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.45 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.89 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.21 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.42 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.42 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.89 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.32 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.33 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.47 
 
 		 306 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.12 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.22 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.39 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  37.56 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.9 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.18 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.38 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.91 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.25 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.75 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.07 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>