More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0554 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 
323 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  58.67 
 
 
325 aa  334  9e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  51.61 
 
 
318 aa  265  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  47.35 
 
 
310 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  45.93 
 
 
291 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  45.9 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.9 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.56 
 
 
289 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.64 
 
 
290 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.76 
 
 
298 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.91 
 
 
285 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  44.23 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.48 
 
 
297 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.7 
 
 
290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  43.3 
 
 
288 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  39.86 
 
 
289 aa  178  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  40.74 
 
 
305 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.2 
 
 
290 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  40.74 
 
 
305 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  46.9 
 
 
310 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  41.41 
 
 
305 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.8 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  42 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  47.69 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  44.19 
 
 
296 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.42 
 
 
291 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  43.97 
 
 
296 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  41.89 
 
 
321 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.78 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  47.47 
 
 
298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  38.76 
 
 
300 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  42.75 
 
 
296 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  45.59 
 
 
309 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  42.64 
 
 
295 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  41.76 
 
 
306 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  43.67 
 
 
305 aa  152  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.15 
 
 
298 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.69 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.42 
 
 
287 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.42 
 
 
287 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.56 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.14 
 
 
299 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  37.46 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  42.59 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.28 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.01 
 
 
299 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  35 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.61 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.73 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.8 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.59 
 
 
327 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.74 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.74 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.74 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.46 
 
 
295 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.53 
 
 
306 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.29 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.56 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.45 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.7 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.57 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.01 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.85 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.87 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.98 
 
 
308 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  36.11 
 
 
284 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.62 
 
 
328 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.21 
 
 
303 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.5 
 
 
300 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
296 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.29 
 
 
309 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.25 
 
 
283 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.7 
 
 
275 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.05 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.3 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.82 
 
 
295 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.51 
 
 
304 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.54 
 
 
296 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.54 
 
 
295 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.27 
 
 
293 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 
304 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.94 
 
 
295 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  34.84 
 
 
286 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 
293 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
294 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0712  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.39 
 
 
292 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.88 
 
 
297 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.47 
 
 
296 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  28.77 
 
 
289 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.5 
 
 
293 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.5 
 
 
293 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.11 
 
 
293 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.5 
 
 
293 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
298 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.61 
 
 
293 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.61 
 
 
293 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.71 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.32 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.88 
 
 
293 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>