More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1594 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 
288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.36 
 
 
285 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.8 
 
 
290 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.27 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  42.37 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.91 
 
 
290 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  48.13 
 
 
296 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  47.42 
 
 
296 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.28 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  46.95 
 
 
295 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.57 
 
 
292 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.3 
 
 
297 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  39.25 
 
 
321 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.86 
 
 
292 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  46.86 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  40.68 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.15 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  41.81 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.22 
 
 
297 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  40.93 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.21 
 
 
289 aa  179  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  40.53 
 
 
300 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  44.6 
 
 
296 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  40.38 
 
 
291 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.91 
 
 
325 aa  175  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.96 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  41.25 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  40.16 
 
 
289 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  41.18 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  46.38 
 
 
306 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  40.78 
 
 
305 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  39.76 
 
 
305 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  43.08 
 
 
306 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  41.11 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  37.65 
 
 
305 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  42.92 
 
 
308 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  39.08 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.07 
 
 
286 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.36 
 
 
318 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  36.64 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.29 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.95 
 
 
286 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.96 
 
 
287 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.96 
 
 
287 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.39 
 
 
287 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  38.32 
 
 
282 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 
275 aa  119  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  38.39 
 
 
286 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.51 
 
 
506 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.51 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.94 
 
 
299 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.83 
 
 
277 aa  115  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.71 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.6 
 
 
327 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.42 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.23 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  35.78 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.04 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.04 
 
 
298 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.91 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.76 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  35.84 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.51 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.24 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.01 
 
 
312 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  37.56 
 
 
283 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 
303 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.01 
 
 
312 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.24 
 
 
298 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 
300 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.38 
 
 
312 aa  105  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.55 
 
 
316 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.84 
 
 
299 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 
302 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.18 
 
 
293 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.48 
 
 
307 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 
295 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.36 
 
 
312 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.01 
 
 
300 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.42 
 
 
293 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.42 
 
 
293 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.42 
 
 
293 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.08 
 
 
309 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.21 
 
 
296 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
289 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.65 
 
 
290 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.29 
 
 
299 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.07 
 
 
300 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.71 
 
 
316 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.17 
 
 
293 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.95 
 
 
303 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 
295 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.36 
 
 
300 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.68 
 
 
293 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.58 
 
 
306 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.09 
 
 
295 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.76 
 
 
292 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>