More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4944 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 		 305 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  99.67 
 
 		 305 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  93.11 
 
 		 305 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  78.69 
 
 		 306 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  75.33 
 
 		 310 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  75.41 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  49.35 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  51.06 
 
 		 296 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  49.32 
 
 		 300 aa  251  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  49.66 
 
 		 296 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  49.12 
 
 		 296 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  49.12 
 
 		 295 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  47.89 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  47.69 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  47 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  46.62 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.38 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  43.18 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.28 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.79 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.01 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.51 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.62 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 		 285 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.69 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  40.74 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  42.75 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.2 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  43.49 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.75 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  41.64 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  40.6 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.57 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.16 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.19 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  36.2 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.59 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  36.47 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 506 aa  122  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.8 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.86 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.46 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.73 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.25 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  37.07 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.95 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.07 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.08 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.41 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.99 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.22 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  33.02 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.36 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.74 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.45 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.64 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.81 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.93 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.07 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.93 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.32 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.81 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.61 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.61 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.81 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.61 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.45 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.26 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.79 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.79 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.55 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.61 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.02 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.43 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.32 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.59 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.96 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.43 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.74 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.16 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.85 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.59 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.59 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.18 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.51 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.65 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.49 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.27 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.67 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.98 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.59 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.47 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  39.27 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.96 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>