More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1671 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.35 
 
 
275 aa  251  7e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.52 
 
 
277 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.97 
 
 
277 aa  238  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.01 
 
 
275 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.73 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.29 
 
 
281 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.93 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.57 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0488  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.08 
 
 
301 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.99 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.55 
 
 
295 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.35 
 
 
296 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.9 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 
297 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.71 
 
 
298 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  36.32 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 
293 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.75 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.15 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.19 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.81 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.94 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.25 
 
 
296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.44 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.47 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.19 
 
 
299 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 
300 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.84 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.27 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.89 
 
 
300 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.25 
 
 
293 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 
312 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 
304 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.27 
 
 
300 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  36.19 
 
 
305 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 
316 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.19 
 
 
313 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.02 
 
 
312 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.79 
 
 
293 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.19 
 
 
313 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.02 
 
 
293 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.02 
 
 
293 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.96 
 
 
300 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.02 
 
 
293 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.02 
 
 
312 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.02 
 
 
312 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.02 
 
 
312 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.02 
 
 
312 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 
313 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.02 
 
 
299 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.02 
 
 
312 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.96 
 
 
300 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.59 
 
 
293 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.31 
 
 
293 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.27 
 
 
298 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.95 
 
 
293 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.13 
 
 
324 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
302 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  36.68 
 
 
264 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.7 
 
 
304 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  36 
 
 
264 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.32 
 
 
293 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.27 
 
 
298 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
300 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
300 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
300 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
300 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.56 
 
 
312 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.32 
 
 
293 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
300 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
300 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.19 
 
 
299 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.64 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.85 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  35.07 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.18 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.47 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  31.58 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.25 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.88 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.68 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  35.71 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  35.71 
 
 
305 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.03 
 
 
290 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.85 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.81 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.07 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.59 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.02 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>