More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6514 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
285 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  42.09 
 
 
276 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.83 
 
 
278 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.36 
 
 
311 aa  199  5e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.07 
 
 
293 aa  195  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.43 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.72 
 
 
279 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  42.69 
 
 
276 aa  175  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.67 
 
 
278 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  37.59 
 
 
285 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.25 
 
 
286 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.7 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.62 
 
 
288 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.13 
 
 
293 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.25 
 
 
290 aa  138  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.85 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.83 
 
 
299 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.28 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.02 
 
 
277 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.92 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.42 
 
 
318 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.65 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.22 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.31 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.86 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.12 
 
 
315 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.32 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.81 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.81 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.41 
 
 
313 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.87 
 
 
308 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  33.65 
 
 
258 aa  109  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.24 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  29.48 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.4 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.82 
 
 
317 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.34 
 
 
317 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.9 
 
 
278 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.51 
 
 
299 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.92 
 
 
300 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
317 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.43 
 
 
315 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.5 
 
 
294 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  32.2 
 
 
264 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  32.2 
 
 
264 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.39 
 
 
319 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  33.99 
 
 
276 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28.36 
 
 
299 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.2 
 
 
312 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 
277 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
295 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.64 
 
 
296 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.92 
 
 
307 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.5 
 
 
299 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.93 
 
 
306 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.02 
 
 
295 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.49 
 
 
293 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.02 
 
 
275 aa  102  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.1 
 
 
293 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.24 
 
 
292 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.1 
 
 
293 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.67 
 
 
295 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.14 
 
 
281 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.14 
 
 
281 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  31.4 
 
 
284 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
304 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  29.58 
 
 
275 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.25 
 
 
295 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  29.37 
 
 
289 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  28.12 
 
 
253 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.34 
 
 
293 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
295 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.95 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.18 
 
 
298 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.77 
 
 
282 aa  98.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 
294 aa  98.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.5 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.14 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.8 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.63 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  30.08 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.52 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.5 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.52 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03936  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.51 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>