More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2421 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
293 aa  597  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  71.68 
 
 
288 aa  428  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  76.57 
 
 
289 aa  424  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  73.05 
 
 
286 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  68.07 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  65.95 
 
 
290 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.4 
 
 
287 aa  345  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  41.96 
 
 
285 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 
278 aa  148  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
312 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  32.14 
 
 
276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.13 
 
 
285 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.32 
 
 
293 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
279 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.96 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.18 
 
 
312 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.47 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0528  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.31 
 
 
295 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0113889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  33.1 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.01 
 
 
278 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.06 
 
 
312 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.43 
 
 
300 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.1 
 
 
312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.34 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.1 
 
 
312 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.1 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.1 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
312 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
312 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
312 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.35 
 
 
302 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
312 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
312 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
309 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.8 
 
 
301 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.76 
 
 
307 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.67 
 
 
312 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.33 
 
 
299 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.16 
 
 
319 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.49 
 
 
315 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2149  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.32 
 
 
295 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.73 
 
 
316 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.91 
 
 
316 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.91 
 
 
290 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.2 
 
 
308 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.01 
 
 
305 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 
315 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
313 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
300 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.58 
 
 
327 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  30.09 
 
 
307 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.11 
 
 
292 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.87 
 
 
295 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.42 
 
 
296 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.62 
 
 
303 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.04 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17811  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.12 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.578713  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  24.83 
 
 
292 aa  99  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  99  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.94 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.42 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.58 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.13 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.44 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  29.79 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.32 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.02 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.02 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.42 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.51 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.53 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.25 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.31 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.89 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.01 
 
 
321 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
506 aa  95.9  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.25 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.25 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0096  ribosomal L11 methyltransferase  31.25 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.9 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.94 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.77 
 
 
295 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  30.95 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  32.39 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.63 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.61 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.02 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.28 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.17 
 
 
308 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.52 
 
 
328 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.19 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.15 
 
 
295 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.77 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.96 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.8 
 
 
299 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.61 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.86 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>