More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2820 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
288 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  71.68 
 
 
293 aa  428  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  73.17 
 
 
289 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  69.61 
 
 
286 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  65.26 
 
 
288 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  62.14 
 
 
290 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  60.64 
 
 
287 aa  349  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  39.92 
 
 
285 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  34.15 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.7 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
278 aa  142  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 
312 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.69 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.09 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.89 
 
 
318 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.02 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.6 
 
 
299 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  26.54 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.19 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  29.84 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.12 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.15 
 
 
308 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.12 
 
 
312 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.12 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.12 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.74 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.74 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.74 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.74 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.74 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  32.06 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.74 
 
 
312 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.62 
 
 
309 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.95 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.2 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.69 
 
 
290 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 
315 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 
299 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.27 
 
 
307 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0528  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
295 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0113889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.97 
 
 
303 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.79 
 
 
316 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.03 
 
 
319 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.28 
 
 
303 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.26 
 
 
315 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.23 
 
 
306 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
302 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
327 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.69 
 
 
300 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.62 
 
 
287 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.62 
 
 
287 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.57 
 
 
306 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.5 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.59 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
316 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.22 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.07 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.75 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.02 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.38 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.02 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.15 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.35 
 
 
299 aa  95.9  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.4 
 
 
317 aa  95.5  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.42 
 
 
299 aa  95.5  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.98 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.02 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.81 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.16 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  32.37 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.98 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.22 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.98 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.85 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.31 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17811  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.44 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.578713  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.63 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.78 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.88 
 
 
313 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.05 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.91 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.31 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.91 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.48 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.07 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.6 
 
 
295 aa  92.8  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 
302 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  30.29 
 
 
296 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2149  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.2 
 
 
312 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.39 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.07 
 
 
294 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.63 
 
 
317 aa  92  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>