More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0635 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 		 311 aa  638    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.48 
 
 		 278 aa  279  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.44 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.66 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.53 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  44.25 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  40 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.36 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.8 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  36.19 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.88 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.53 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.36 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.45 
 
 		 288 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.32 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  31.8 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.45 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  36.22 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  30.41 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.18 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.07 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.45 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.18 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.34 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.16 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.87 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.63 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.22 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.16 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  32.32 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.16 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.16 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.92 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.2 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  30.27 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.66 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  34.76 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.66 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.48 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.79 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.15 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.21 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.62 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  33.88 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.49 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.75 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.36 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.49 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.36 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.36 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.36 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.36 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.36 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.3 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.36 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.02 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.3 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.19 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.97 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  30.15 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.61 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.98 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.27 
 
 		 296 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.74 
 
 		 302 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.58 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.85 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.74 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.92 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.22 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.02 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  33.02 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.61 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.68 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.68 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.24 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  31.14 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.49 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.54 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.68 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>