More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0246 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  100 
 
 
287 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  98.26 
 
 
287 aa  534  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  98.26 
 
 
287 aa  534  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  79.79 
 
 
286 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.37 
 
 
299 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.61 
 
 
302 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.26 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.55 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.61 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.61 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.26 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.61 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.61 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.61 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.61 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.26 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.2 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.55 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.55 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.55 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.97 
 
 
300 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.96 
 
 
298 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.61 
 
 
315 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.94 
 
 
298 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.13 
 
 
299 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.97 
 
 
300 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.67 
 
 
309 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.56 
 
 
298 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3080  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.38 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.08 
 
 
306 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.6 
 
 
300 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.13 
 
 
300 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  51.83 
 
 
299 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.54 
 
 
306 aa  158  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.71 
 
 
297 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.7 
 
 
293 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
296 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.71 
 
 
304 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.37 
 
 
302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.09 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.49 
 
 
296 aa  155  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.24 
 
 
293 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.06 
 
 
327 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.7 
 
 
295 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.07 
 
 
295 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.34 
 
 
295 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.33 
 
 
506 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.78 
 
 
308 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.26 
 
 
293 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.16 
 
 
295 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.5 
 
 
307 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.45 
 
 
294 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 
295 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.13 
 
 
295 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.78 
 
 
294 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 
293 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 
306 aa  148  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
295 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 
293 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  46.26 
 
 
253 aa  148  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.5 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  40.43 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.04 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.04 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.04 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.44 
 
 
293 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.2 
 
 
293 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  42.97 
 
 
286 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  45.05 
 
 
284 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.09 
 
 
294 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.43 
 
 
298 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.24 
 
 
293 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 
294 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.04 
 
 
305 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 
293 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.74 
 
 
292 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 
293 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.67 
 
 
297 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.49 
 
 
312 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.07 
 
 
296 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.91 
 
 
290 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.86 
 
 
292 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.93 
 
 
293 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 
293 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  44.91 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.26 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.74 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.57 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.08 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.08 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.08 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.74 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.08 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.95 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.97 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.08 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.26 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.74 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>