More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1435 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 
276 aa  549  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.16 
 
 
304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0784  ribosomal L11 methyltransferase  35.91 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.28 
 
 
315 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.55 
 
 
277 aa  126  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.76 
 
 
312 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.73 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  29.34 
 
 
285 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.52 
 
 
277 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.12 
 
 
299 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.25 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.14 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 
316 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.43 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  33 
 
 
264 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.27 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.91 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.65 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.08 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.99 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.14 
 
 
312 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.14 
 
 
312 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  32 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.76 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.76 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.76 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.76 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.76 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.03 
 
 
293 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  31.28 
 
 
253 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.55 
 
 
324 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.24 
 
 
312 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.88 
 
 
297 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.5 
 
 
309 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 
317 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.84 
 
 
289 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.22 
 
 
298 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.15 
 
 
296 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.65 
 
 
306 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  34.83 
 
 
307 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.69 
 
 
307 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0488  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.98 
 
 
301 aa  101  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.85 
 
 
300 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.22 
 
 
312 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.22 
 
 
312 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.38 
 
 
306 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.26 
 
 
300 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.63 
 
 
275 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 
315 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  28.64 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.98 
 
 
296 aa  99  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.14 
 
 
315 aa  99  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.86 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.2 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.51 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.98 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.86 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.92 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  33.49 
 
 
258 aa  94  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.87 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.93 
 
 
308 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.01 
 
 
295 aa  92  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.53 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.56 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.44 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.41 
 
 
307 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
301 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.96 
 
 
293 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.61 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.86 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.61 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0096  ribosomal L11 methyltransferase  25.69 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.68 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.68 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.68 
 
 
306 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.09 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.99 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.42 
 
 
308 aa  89.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.99 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.36 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.33 
 
 
293 aa  89  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  29.02 
 
 
284 aa  89  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.96 
 
 
295 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.61 
 
 
295 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.99 
 
 
281 aa  88.6  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.93 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  27.34 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.13 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.21 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.62 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.34 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>