More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2947 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  98.99 
 
 
297 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  79.46 
 
 
296 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  79.8 
 
 
293 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  79.05 
 
 
294 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  76.35 
 
 
297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  74.07 
 
 
307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  72.64 
 
 
298 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  73.09 
 
 
300 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3351  ribosomal protein L11 methyltransferase  73.42 
 
 
301 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  66.45 
 
 
301 aa  361  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.79 
 
 
297 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.14 
 
 
304 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.32 
 
 
300 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.46 
 
 
300 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.14 
 
 
296 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.82 
 
 
298 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.18 
 
 
300 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  47 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.86 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.2 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.02 
 
 
300 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.47 
 
 
298 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.2 
 
 
300 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.2 
 
 
300 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.84 
 
 
300 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.4 
 
 
298 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.27 
 
 
300 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 
300 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 
300 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 
300 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 
300 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 
300 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 
300 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 
302 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.59 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.07 
 
 
506 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.44 
 
 
300 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.9 
 
 
328 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.37 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.64 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.67 
 
 
293 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.67 
 
 
293 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.67 
 
 
293 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.67 
 
 
293 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.52 
 
 
290 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 
293 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 
293 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.33 
 
 
293 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.33 
 
 
293 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.67 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.38 
 
 
293 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 
293 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.21 
 
 
293 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.66 
 
 
299 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.79 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.33 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.14 
 
 
301 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  35 
 
 
293 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3446  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.69 
 
 
298 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.11 
 
 
295 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.33 
 
 
295 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.86 
 
 
295 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35 
 
 
295 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.37 
 
 
295 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 
296 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  35.15 
 
 
311 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.02 
 
 
307 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.21 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4608  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.79 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4871  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.79 
 
 
292 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.22 
 
 
295 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.8 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.98 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.64 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.82 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1402  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.09 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000377664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.55 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4693  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.8 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.82 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.83 
 
 
303 aa  162  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.67 
 
 
294 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.11 
 
 
293 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.11 
 
 
293 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.47 
 
 
294 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0617  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.47 
 
 
292 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00809563  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0712  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.76 
 
 
292 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.82 
 
 
294 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4402  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 
292 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.52 
 
 
289 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.59 
 
 
292 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.95 
 
 
289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4862  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.47 
 
 
292 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.75 
 
 
292 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3652  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.02 
 
 
306 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.851173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>