More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2060 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  100 
 
 		 286 aa  567  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  44.9 
 
 		 296 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  44.96 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.86 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.66 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  46.13 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  48.44 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  46.61 
 
 		 289 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  45.7 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.7 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  46.09 
 
 		 291 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  44.79 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.46 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  46.77 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  44.06 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  43.7 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.96 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  43.6 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  47.18 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.89 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  44.36 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  49.05 
 
 		 295 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  43.75 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  43.02 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.83 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  46.19 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.58 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.79 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.92 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.87 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  45.7 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  45.77 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  45.07 
 
 		 288 aa  161  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  37.69 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  47.42 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.08 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.05 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  41.36 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.1 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.04 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.04 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.32 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  40.7 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 		 506 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.97 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.56 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.62 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.97 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.56 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.62 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.9 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.56 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  40.09 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.12 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.47 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.19 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.13 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.02 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.79 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.14 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.24 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.07 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.09 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  39.18 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.5 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.72 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.55 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.48 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.63 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.81 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.57 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.64 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.62 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.31 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.33 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.45 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.1 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.62 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.57 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.9 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.5 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.1 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>