More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0212 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 
301 aa  600  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  55.33 
 
 
305 aa  295  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.23 
 
 
297 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  40.91 
 
 
296 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.55 
 
 
290 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  44.29 
 
 
296 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.64 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.33 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  44.55 
 
 
321 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  43.81 
 
 
295 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.35 
 
 
292 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.6 
 
 
298 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.75 
 
 
290 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  43.33 
 
 
298 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.16 
 
 
285 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  37.91 
 
 
310 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  41.06 
 
 
289 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  41.82 
 
 
296 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.4 
 
 
292 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.63 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  42.52 
 
 
300 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  38.52 
 
 
291 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  38.52 
 
 
291 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  45.79 
 
 
306 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.52 
 
 
291 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  35.29 
 
 
289 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  36.64 
 
 
288 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  38.02 
 
 
305 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.09 
 
 
290 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.98 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  37.46 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  36.47 
 
 
305 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  40 
 
 
306 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  36.47 
 
 
305 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  40.23 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.65 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.72 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.82 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 
506 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.22 
 
 
306 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  40.15 
 
 
309 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.59 
 
 
290 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.46 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.32 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  33.01 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.62 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.45 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.53 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3037  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.4 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  41.51 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.47 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.86 
 
 
315 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.27 
 
 
300 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.56 
 
 
299 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.69 
 
 
318 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.27 
 
 
300 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.27 
 
 
300 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.7 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.24 
 
 
300 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.28 
 
 
300 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  37.73 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.24 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.85 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.24 
 
 
300 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.42 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.55 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2137  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.55 
 
 
337 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.37 
 
 
307 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.95 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.14 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.13 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
300 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.19 
 
 
294 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.52 
 
 
286 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.34 
 
 
298 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.88 
 
 
300 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.02 
 
 
298 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.54 
 
 
313 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.86 
 
 
315 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  35.78 
 
 
283 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3080  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.73 
 
 
307 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  37.32 
 
 
296 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.25 
 
 
306 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 
286 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.55 
 
 
304 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.05 
 
 
313 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.96 
 
 
312 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.85 
 
 
292 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.63 
 
 
302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.96 
 
 
312 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.14 
 
 
287 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.1 
 
 
299 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.85 
 
 
292 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.96 
 
 
312 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.96 
 
 
312 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  36.36 
 
 
286 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.91 
 
 
317 aa  102  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
296 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>