More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2089 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  56.52 
 
 		 300 aa  332  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  53.27 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  52.45 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  53.15 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  53.66 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  52.96 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  49.35 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  49.35 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  52.3 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  53.27 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  52.61 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  49.35 
 
 		 305 aa  275  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  53.5 
 
 		 295 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  51.32 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  51.96 
 
 		 309 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.58 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.49 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  43.64 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.11 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.59 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.53 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.7 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.64 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.26 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  47.69 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.39 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  48.08 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  46.38 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  42.7 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.19 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.7 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  46.23 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.46 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  40.51 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.4 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  46.26 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  46.15 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.86 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.32 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.64 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.41 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.41 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.41 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.64 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.88 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  39.35 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.19 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.58 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.94 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.27 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  38.14 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.74 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.88 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.27 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.65 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.58 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.97 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.2 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.33 
 
 		 275 aa  99.4  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 315 aa  99  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.18 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.07 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.02 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.85 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.73 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.08 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.02 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.21 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.29 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.24 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.36 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.68 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.51 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  26.86 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.68 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.15 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.68 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.36 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.75 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.36 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.92 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.23 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.62 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.68 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.92 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.67 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.23 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.2 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>