More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3047 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  92.92 
 
 		 242 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  79.44 
 
 		 250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  76.54 
 
 		 242 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  76.54 
 
 		 242 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  77.14 
 
 		 246 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  71.37 
 
 		 239 aa  357  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  71.37 
 
 		 239 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  65.81 
 
 		 241 aa  318  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  62.45 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  60.76 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  38.53 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.27 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 1106 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  37.74 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  43.43 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  28.85 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.12 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.23 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  27.54 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 		 1005 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 1002 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  33.11 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  31.43 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  36 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  30.27 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.18 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.25 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.38 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  37.61 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.71 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  34.75 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.94 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  30.13 
 
 		 351 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  39.62 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  34.58 
 
 		 351 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.86 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  29.87 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  31.45 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>