21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1555 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1555  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  463  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1554  hypothetical protein  40.26 
 
 
227 aa  172  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  25 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  24.76 
 
 
341 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  27.68 
 
 
345 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  32.38 
 
 
330 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.91 
 
 
291 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  30.77 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  30.77 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.44 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  24.76 
 
 
341 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  25 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1967  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  29.09 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
243 aa  42  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
332 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2530  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1609  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
156 aa  41.6  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.682504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.39 
 
 
300 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>