69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0121 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  100 
 
 		 330 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  35.65 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2080  methyltransferase type 12  31.35 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.07 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  24.24 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  22.91 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  28.31 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 2490 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  22.49 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  25.64 
 
 		 196 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  25.64 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  25 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.84 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  25.64 
 
 		 196 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1554  hypothetical protein  28.95 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.16 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1555  hypothetical protein  32.38 
 
 		 228 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  29.25 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.55 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.55 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.45 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.45 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  27.52 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31140  methyltransferase family protein  23.53 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.18 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.04 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.18 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.18 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  24.24 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.18 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  29.87 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.25 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.18 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  27.91 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.76 
 
 		 238 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 209 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.93 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  47.5 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 229 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.23 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.23 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1366  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.18 
 
 		 232 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  30.56 
 
 		 210 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 202 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  30.67 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.17 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 233 aa  42.7  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2173  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  28.57 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000226559  hitchhiker  0.00157029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.08 
 
 		 242 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  24.58 
 
 		 237 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  23.81 
 
 		 200 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>