240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0122 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  100 
 
 
363 aa  753    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
314 aa  96.3  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0495  methyltransferase type 12  34.94 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.54 
 
 
265 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.2 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  26 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
200 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1935  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
285 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1366  methyltransferase type 11  23.96 
 
 
288 aa  56.6  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  56.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0899  methyltransferase  24.89 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
268 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.75 
 
 
232 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
241 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
206 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
235 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
225 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.96 
 
 
243 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
243 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  28.66 
 
 
260 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  26.24 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  28.66 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  28.21 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  25.84 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  36.36 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
208 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
255 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.11 
 
 
237 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
337 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
225 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
352 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  26.49 
 
 
253 aa  49.7  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
251 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  29.2 
 
 
287 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
216 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  30.1 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  31.07 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
241 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.29 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  36.36 
 
 
61 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2258  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.951414  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
207 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  34.65 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
238 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  26.14 
 
 
168 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35 
 
 
272 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  26.81 
 
 
257 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 
269 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  25 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  32.14 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.58 
 
 
345 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.71 
 
 
237 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
216 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  31.07 
 
 
251 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  34.95 
 
 
240 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
207 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
207 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
237 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
226 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
249 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.97 
 
 
234 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.52 
 
 
250 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.03 
 
 
255 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  30 
 
 
269 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 
251 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  30.1 
 
 
251 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  26.92 
 
 
779 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
237 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 
328 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
215 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  41.18 
 
 
55 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.97 
 
 
232 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
232 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>