140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3123 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3123  ribosomal protein L11 methylase-like protein  100 
 
 
364 aa  743    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.835612  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  30.07 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  30.2 
 
 
345 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51802  predicted protein  28.57 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54710  predicted protein  33.33 
 
 
410 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0960644  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03520  protein arginine n-methyltransferase, putative  27.84 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0885983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 
389 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17184  predicted protein  27.84 
 
 
445 aa  93.6  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  26.35 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  36.75 
 
 
596 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06620  protein-arginine N-methyltransferase, putative  31.74 
 
 
480 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.129536  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03096  Protein methyltransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VK73]  33.78 
 
 
542 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013321  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  30.47 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0805  Histone-arginine N-methyltransferase  29.46 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88314  predicted protein  37.69 
 
 
542 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.333395  normal  0.0216247 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0135  putative RNA methylase  32.06 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  26.74 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0848  putative RNA methylase  29.23 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.231779  normal  0.0319952 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0913  methyltransferase small  29.69 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1807  putative RNA methylase  28.91 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.33 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2196  hypothetical protein  26.37 
 
 
297 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109141  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.06 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.53 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.71 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  44.59 
 
 
1080 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  38.78 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2724  hypothetical protein  33.64 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.33 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
281 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4728  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.06 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.228572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.93 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  27.94 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.89 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.85 
 
 
327 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
267 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.17 
 
 
215 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  33.05 
 
 
189 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.21 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.21 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.21 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.21 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.21 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.58 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.33 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  31.86 
 
 
247 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 
265 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  30.07 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.53 
 
 
312 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.44 
 
 
312 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.56 
 
 
244 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.04 
 
 
278 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2108  precorrin-6B methylase 2-like protein  32.46 
 
 
181 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.538853  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  34.31 
 
 
282 aa  47  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
267 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 
238 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.65 
 
 
287 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 
262 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  25.43 
 
 
541 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  31.58 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  33.6 
 
 
1014 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
272 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.82 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.82 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  34.25 
 
 
199 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  25.43 
 
 
541 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.85 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  35 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.46 
 
 
268 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.22 
 
 
212 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2640  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  36.62 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.48 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  38.83 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.51 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.66 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  28.18 
 
 
541 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.66 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.66 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  28.18 
 
 
541 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.66 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.66 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
262 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.33 
 
 
233 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  27.94 
 
 
306 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.97 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>