More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0687 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  93.55 
 
 		 217 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  78.34 
 
 		 218 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  78.7 
 
 		 219 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  79.63 
 
 		 219 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  78.5 
 
 		 218 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  76.96 
 
 		 219 aa  313  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  78.8 
 
 		 220 aa  313  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  78.8 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  77.42 
 
 		 219 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  43.52 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  43.14 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  34.03 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  36.93 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  40.52 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  38.07 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  40.12 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  37.77 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  36.31 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  37.25 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  48.08 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  48.08 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  35.75 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  41.94 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  37.64 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  42.58 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  32.64 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  42.14 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  41.51 
 
 		 220 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  41.98 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  36.6 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  35.06 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  43.41 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  34.46 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  38.1 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  39.06 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  38.46 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  40.48 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  43.86 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  48.11 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  35.06 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  39.19 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  38.51 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  39.33 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  37.84 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  38.67 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  38.67 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  36.52 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  36.44 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  40.28 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  42.53 
 
 		 338 aa  65.5  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  39.29 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  40.48 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  35.04 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  38.52 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  39.74 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  45.22 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  39.29 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  32.76 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  33.91 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.46 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.46 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  32.4 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  54 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  31.11 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.74 
 
 		 300 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.74 
 
 		 300 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  38.54 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.74 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.74 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  45.33 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.82 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  52 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.06 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  31.21 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.76 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.74 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.18 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  34.15 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.74 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.24 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.29 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.84 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.18 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.56 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.18 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.18 
 
 		 301 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.18 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  32.43 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>