223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1069 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0848  putative RNA methylase  90 
 
 
260 aa  474  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.231779  normal  0.0319952 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1807  putative RNA methylase  89.62 
 
 
260 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0913  methyltransferase small  78.85 
 
 
260 aa  425  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0135  putative RNA methylase  66.29 
 
 
264 aa  347  9e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3123  ribosomal protein L11 methylase-like protein  30.47 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.835612  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.31 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.31 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.61 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  33.56 
 
 
566 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  25.35 
 
 
389 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2196  hypothetical protein  24.3 
 
 
297 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109141  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 
452 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.91 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.77 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.75 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.95 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  28 
 
 
394 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  32.12 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.16 
 
 
312 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.16 
 
 
312 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.16 
 
 
312 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.16 
 
 
312 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.16 
 
 
312 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.95 
 
 
312 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  31.4 
 
 
1080 aa  59.3  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88314  predicted protein  29.25 
 
 
542 aa  59.3  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.333395  normal  0.0216247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.16 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.16 
 
 
312 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51802  predicted protein  32.35 
 
 
340 aa  55.8  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.16 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.48 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
302 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.05 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  36.14 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
300 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
300 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
300 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
300 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
300 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
300 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.14 
 
 
318 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  39.19 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.07 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
298 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  26.4 
 
 
596 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
300 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.45 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  32.54 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.28 
 
 
307 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.09 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.69 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.78 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  38.36 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54710  predicted protein  28.03 
 
 
410 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0960644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  30.56 
 
 
311 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
309 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.83 
 
 
327 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.39 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  34.86 
 
 
336 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0624  ribosomal L11 methyltransferase  29.06 
 
 
288 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.404833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.17 
 
 
312 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.17 
 
 
312 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 
315 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.74 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.74 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  29.66 
 
 
382 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.74 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  42.59 
 
 
227 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  30 
 
 
328 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.89 
 
 
296 aa  48.9  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0805  Histone-arginine N-methyltransferase  30.56 
 
 
345 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3721  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4016  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  30.77 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0917362  normal  0.375837 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.66 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  32.22 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  27.97 
 
 
382 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.83 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2122  putative methyltransferase  35.05 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  36.56 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.83 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.36 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  43.55 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.97 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  43.55 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21190  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit,precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  36.76 
 
 
451 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.03 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2044  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.11 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>