178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2360 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  100 
 
 
319 aa  664    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  70.71 
 
 
298 aa  432  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  54.38 
 
 
293 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  46.62 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  41.53 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  34.27 
 
 
302 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  33.45 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  33.7 
 
 
278 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  35.18 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
279 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  32.86 
 
 
291 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  36.91 
 
 
279 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  32.21 
 
 
274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  32.81 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  35.24 
 
 
276 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  29.67 
 
 
278 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  34.01 
 
 
277 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  35.71 
 
 
283 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
293 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
287 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  31.84 
 
 
291 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  27.11 
 
 
283 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  27.78 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  27.04 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  33.65 
 
 
275 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  30.52 
 
 
254 aa  89  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  29.03 
 
 
279 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  29.58 
 
 
254 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  34.67 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  34 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  28.87 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  31.98 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  26.46 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  32.69 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  34 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  28.65 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  29.36 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  29.5 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  25.99 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  31.71 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  25.43 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  26.82 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  26.01 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
288 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.81 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  31.08 
 
 
284 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  26.17 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  25.13 
 
 
191 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
284 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  37.11 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  28.21 
 
 
271 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  37.08 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  25.58 
 
 
265 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  29.63 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  24.3 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  29.52 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  33.61 
 
 
244 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  36.17 
 
 
201 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  32.05 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.94 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  49.02 
 
 
246 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.24 
 
 
352 aa  50.4  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  32.46 
 
 
208 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  56.1 
 
 
260 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  36.56 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.51 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 
541 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  32.04 
 
 
541 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  32.04 
 
 
541 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  28.32 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 
541 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
217 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 
541 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.72 
 
 
229 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3103  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00714601  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
278 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
278 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.23 
 
 
233 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0913  methyltransferase small  36.27 
 
 
260 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  33.33 
 
 
201 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  46.43 
 
 
378 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  57.14 
 
 
242 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.56 
 
 
233 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
277 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.23 
 
 
233 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
267 aa  46.2  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
245 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  30.09 
 
 
284 aa  45.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>