187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1807 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1807  putative RNA methylase  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0848  putative RNA methylase  92.31 
 
 
260 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.231779  normal  0.0319952 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  89.62 
 
 
260 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0913  methyltransferase small  80 
 
 
260 aa  424  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0135  putative RNA methylase  65.15 
 
 
264 aa  341  5.999999999999999e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  34.25 
 
 
566 aa  72  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.04 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.04 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3123  ribosomal protein L11 methylase-like protein  28.12 
 
 
364 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.835612  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2196  hypothetical protein  26.97 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109141  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.82 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.1 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  27.98 
 
 
394 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.1 
 
 
315 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 
452 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.8 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.63 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  29.01 
 
 
389 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 
312 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  44.44 
 
 
292 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51802  predicted protein  33.09 
 
 
340 aa  55.8  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88314  predicted protein  25.67 
 
 
542 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.333395  normal  0.0216247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.2 
 
 
312 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.2 
 
 
312 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.2 
 
 
312 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.2 
 
 
312 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  27.69 
 
 
596 aa  55.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.2 
 
 
312 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.17 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.92 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.2 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  28.93 
 
 
1080 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.33 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.65 
 
 
309 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.85 
 
 
308 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17184  predicted protein  30.66 
 
 
445 aa  52  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54710  predicted protein  29.55 
 
 
410 aa  52  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0960644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4016  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  32.56 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0917362  normal  0.375837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.69 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  34.23 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  33.33 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0882  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  32.56 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0433  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  32.56 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0912  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  32.56 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  29.93 
 
 
345 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
296 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2122  putative methyltransferase  35.64 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0624  ribosomal L11 methyltransferase  32.38 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.404833  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  32.08 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2479  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  31.11 
 
 
217 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107993  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03096  Protein methyltransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VK73]  27.15 
 
 
542 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013321  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.42 
 
 
292 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.73 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.91 
 
 
290 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.86 
 
 
299 aa  48.5  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2173  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  30 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0736  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2569  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2044  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  27.54 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0697  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.69 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0276525  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1230  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0668757  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3124  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  30 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.98 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0800  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.21 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0789  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.21 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3063  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3721  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3099  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  35.78 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  39.66 
 
 
247 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  32.35 
 
 
578 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.36 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49245  predicted protein  23.19 
 
 
717 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  35.37 
 
 
355 aa  46.6  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1619  ribosomal L11 methyltransferase  32.22 
 
 
286 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.749866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1764  FkbM family methyltransferase  40.35 
 
 
213 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.268412  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.96 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.99 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.99 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3924  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  26.11 
 
 
217 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2709  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  33.87 
 
 
217 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2082  precorrin-6Y C(5,15)-methyltransferase (decarboxylating)  38.6 
 
 
418 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.82 
 
 
300 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  32.43 
 
 
296 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0107  ribosomal L11 methyltransferase  27.27 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.95 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.49 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>