More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1619 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1619  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 
286 aa  589  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.749866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.87 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.32 
 
 
295 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 
289 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.75 
 
 
312 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.02 
 
 
312 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.02 
 
 
312 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.02 
 
 
312 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.75 
 
 
312 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.75 
 
 
312 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.02 
 
 
312 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.02 
 
 
312 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.31 
 
 
312 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.54 
 
 
299 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 
312 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.46 
 
 
309 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.39 
 
 
295 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.48 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.79 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.79 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.48 
 
 
298 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  26.37 
 
 
307 aa  99  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.02 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.92 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.6 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.88 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.42 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.15 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  35.81 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.44 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.7 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.36 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.49 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.21 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.47 
 
 
316 aa  95.9  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.08 
 
 
295 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.78 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.35 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.35 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.35 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.92 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.88 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.95 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.94 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.33 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.33 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.7 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.7 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.32 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.08 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.24 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.86 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.86 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.25 
 
 
300 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.35 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  35.09 
 
 
311 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.92 
 
 
300 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.75 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.91 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.82 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
302 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.94 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.25 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2157  50S ribosomal protein L11 methyltransferase  30.09 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.29 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.29 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.57 
 
 
290 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.76 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.29 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  27.89 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.55 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.33 
 
 
306 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.95 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.83 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.37 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.37 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.95 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.37 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.52 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.21 
 
 
312 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  27.6 
 
 
289 aa  89  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  28.57 
 
 
310 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.31 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.4 
 
 
293 aa  89  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.05 
 
 
315 aa  89  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.7 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.39 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.99 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>