53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54710 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_54710  predicted protein  100 
 
 
410 aa  866    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0960644  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  43.79 
 
 
394 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03520  protein arginine n-methyltransferase, putative  33.71 
 
 
342 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0885983  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17184  predicted protein  32.76 
 
 
445 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03096  Protein methyltransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VK73]  32.11 
 
 
542 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013321  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  32.55 
 
 
596 aa  162  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51802  predicted protein  29.72 
 
 
340 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  30.4 
 
 
345 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06620  protein-arginine N-methyltransferase, putative  32.45 
 
 
480 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.129536  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  30.42 
 
 
270 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3123  ribosomal protein L11 methylase-like protein  33.33 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.835612  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  28.32 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2196  hypothetical protein  29.44 
 
 
297 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109141  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0135  putative RNA methylase  33.58 
 
 
264 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  32.68 
 
 
566 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0805  Histone-arginine N-methyltransferase  32.62 
 
 
345 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0913  methyltransferase small  31.11 
 
 
260 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  33.77 
 
 
1080 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.77 
 
 
312 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.96 
 
 
315 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0848  putative RNA methylase  31.11 
 
 
260 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.231779  normal  0.0319952 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1807  putative RNA methylase  29.55 
 
 
260 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 
452 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  38.27 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  28.03 
 
 
260 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
269 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88314  predicted protein  25.47 
 
 
542 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.333395  normal  0.0216247 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  25.79 
 
 
260 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.94 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
269 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.18 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.24 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.14 
 
 
308 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  37.04 
 
 
296 aa  44.3  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
312 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.71 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.71 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.71 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.71 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.71 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  34.12 
 
 
276 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2157  50S ribosomal protein L11 methyltransferase  27.72 
 
 
306 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  22.29 
 
 
330 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  22.29 
 
 
330 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  22.29 
 
 
330 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.93 
 
 
306 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 
315 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.75 
 
 
296 aa  43.1  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>