More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  34.9 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  34.97 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  33.9 
 
 		 400 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4470  methyltransferase small  34.13 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.820054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  36.52 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  37.65 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  28.81 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  36.26 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  28.97 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  36.63 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  32.12 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.56 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  40.5 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  35.33 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  40.5 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  27.72 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  32.24 
 
 		 409 aa  72  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  29.15 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  31.01 
 
 		 386 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  38.84 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  43.24 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  34.78 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.44 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  35.33 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2467  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.12 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.466168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  35.96 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  32.31 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  36.84 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1845  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  32.28 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0122035 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  54.05 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  32.31 
 
 		 382 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  30.07 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  30.05 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  33.88 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  32 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  29.53 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  25.46 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0701  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.57 
 
 		 321 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  37.17 
 
 		 377 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  39.26 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2092  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.22 
 
 		 300 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  34.31 
 
 		 324 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  42.11 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  33.33 
 
 		 382 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  32.43 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  32.31 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  31.03 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1540  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.32 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  39.47 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.51 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  38.05 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  29.73 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  33.88 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  33.9 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  31.85 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  33.77 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  35.96 
 
 		 397 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  31.52 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  34.06 
 
 		 377 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  45.98 
 
 		 536 aa  65.1  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  29.66 
 
 		 404 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119513  protein methyltransferase  47.5 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.05 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  29.52 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  21.78 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  28.33 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  33.33 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1719  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.35 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  33.33 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  34.21 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.16 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  35.59 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  30.81 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  35.17 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  33.04 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  36.29 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.7 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.22 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  26.83 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  35.4 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  32.74 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  33.63 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  35.4 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2252  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.75 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2223  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.3 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1993  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.32 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  34.48 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.28 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  35.65 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  34.51 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.18 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.62 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.74 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23730  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.41 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.53 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.08 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  33.88 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  48 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>