More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0419 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  82.35 
 
 		 389 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  94.12 
 
 		 374 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  73.75 
 
 		 380 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  73.75 
 
 		 380 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  74.07 
 
 		 376 aa  564  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  72.75 
 
 		 378 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  72.49 
 
 		 378 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  72.22 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  72.49 
 
 		 378 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  72.49 
 
 		 378 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  71.96 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  72.22 
 
 		 378 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  71.69 
 
 		 378 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  72.94 
 
 		 377 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  72.41 
 
 		 377 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  72.41 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  72.41 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  73.21 
 
 		 377 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  71.88 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  72.41 
 
 		 377 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  66.23 
 
 		 381 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  67.74 
 
 		 379 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  66.49 
 
 		 368 aa  498  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  65.68 
 
 		 392 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  62.59 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  64.25 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  59.79 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  61.42 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  63.54 
 
 		 388 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  60.27 
 
 		 384 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  57.96 
 
 		 425 aa  431  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  63.52 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  59.22 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  61.94 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  56.31 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  48.85 
 
 		 400 aa  365  1e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  49.75 
 
 		 404 aa  358  7e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  49.36 
 
 		 404 aa  355  5e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  51.9 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  50.67 
 
 		 382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  50.67 
 
 		 382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  45.41 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  49.59 
 
 		 386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  57.83 
 
 		 89 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  30.07 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  32.97 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  31.93 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  31.82 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  33.12 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  33.93 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  33.06 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  26.01 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  26.01 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.27 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  33.09 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  40 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  35.16 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  30.46 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  36.11 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  36.11 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  40 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  40 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  28.57 
 
 		 208 aa  57  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  35.54 
 
 		 278 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  26.35 
 
 		 202 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  30.19 
 
 		 536 aa  57  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.91 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  35.25 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  26.98 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0685  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  35.16 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  31.74 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  26.19 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.5 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  30.97 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  30.42 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.41 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  40.96 
 
 		 286 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  38.24 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 313 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  37.89 
 
 		 249 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  31.3 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.75 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  38.89 
 
 		 285 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.1 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  37.01 
 
 		 304 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.63 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.13 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  32.35 
 
 		 239 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  32.64 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  30.88 
 
 		 285 aa  53.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  30.38 
 
 		 284 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  31.78 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  34.51 
 
 		 280 aa  53.1  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.34 
 
 		 288 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  31.98 
 
 		 255 aa  52.8  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  27.22 
 
 		 238 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  26.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  29.53 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>