258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0488 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  100 
 
 		 389 aa  796    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  61.76 
 
 		 378 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  62.02 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  61.76 
 
 		 378 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  61.76 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  61.76 
 
 		 378 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  62.02 
 
 		 378 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  61.76 
 
 		 378 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  60.72 
 
 		 378 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  61.2 
 
 		 376 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  57.92 
 
 		 381 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  60.58 
 
 		 380 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  60.58 
 
 		 380 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  58.29 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  58.81 
 
 		 377 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  59.79 
 
 		 374 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  58.29 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  58.29 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  59.07 
 
 		 377 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  57.77 
 
 		 377 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  59.27 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  58.75 
 
 		 374 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  58.81 
 
 		 377 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  57.82 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  59.49 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  58.23 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  56.43 
 
 		 368 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  56.66 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  55.58 
 
 		 379 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  55.81 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  56.2 
 
 		 403 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  52.86 
 
 		 384 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  50.25 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  52.14 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  50.61 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  55.04 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  54.01 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  48.25 
 
 		 404 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  47.74 
 
 		 404 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  44.27 
 
 		 378 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  41.51 
 
 		 382 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  40.16 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  38.32 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  36.86 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  68.54 
 
 		 89 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  29.84 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.01 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  30.16 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.44 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  31.79 
 
 		 284 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  30.67 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  29.94 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  30.67 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.49 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.06 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  30.59 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.4 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.62 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.08 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  27.37 
 
 		 284 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  29.75 
 
 		 227 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.88 
 
 		 276 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  31.62 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  30.49 
 
 		 276 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  29.82 
 
 		 262 aa  53.9  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  38.3 
 
 		 285 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  27.59 
 
 		 202 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  27.96 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  30.18 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  32.45 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  26.59 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  27.17 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  28.16 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  28.99 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.7 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.47 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  28.3 
 
 		 284 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  28.99 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  28.99 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.69 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  25.23 
 
 		 283 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  28.72 
 
 		 278 aa  50.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  29.23 
 
 		 164 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  31.91 
 
 		 288 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 288 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  32.71 
 
 		 245 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  29.27 
 
 		 382 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  31.37 
 
 		 200 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  31.11 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  29.07 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.07 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  29.07 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.74 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  27.1 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  29.07 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  29.07 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  26.94 
 
 		 243 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.31 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  28.12 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>