207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0034 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  751    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  98.94 
 
 
425 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  94.43 
 
 
378 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  751    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  99.74 
 
 
396 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  98.94 
 
 
378 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  99.74 
 
 
378 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  100 
 
 
378 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  81.48 
 
 
377 aa  607  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  81.48 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  80.95 
 
 
377 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  81.48 
 
 
397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  81.48 
 
 
397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  80.42 
 
 
377 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  80.69 
 
 
377 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  75.93 
 
 
376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  73.56 
 
 
380 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  73.56 
 
 
380 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  72.49 
 
 
374 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  73.02 
 
 
389 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  70.23 
 
 
381 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  70.63 
 
 
374 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  69.15 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  68.1 
 
 
392 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  61.76 
 
 
389 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  65.92 
 
 
368 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  64.6 
 
 
417 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  65.63 
 
 
409 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  63.8 
 
 
417 aa  474  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  62.13 
 
 
384 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  64.95 
 
 
388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  60.85 
 
 
425 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  64.66 
 
 
390 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  64.66 
 
 
390 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  58.73 
 
 
403 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  61.11 
 
 
358 aa  418  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  50.38 
 
 
400 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  50.37 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  50.63 
 
 
404 aa  350  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  52.45 
 
 
378 aa  348  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  52.8 
 
 
382 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  52.53 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  47.29 
 
 
414 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  51.89 
 
 
386 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  61.63 
 
 
89 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  35.43 
 
 
285 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  32.89 
 
 
227 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  33.04 
 
 
227 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  29.05 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  29.05 
 
 
286 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  29.05 
 
 
286 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  34.43 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  29.22 
 
 
307 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.49 
 
 
286 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  31.07 
 
 
278 aa  54.3  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  32.74 
 
 
276 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  30.67 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  25.25 
 
 
238 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1456  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.33 
 
 
391 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000347757  normal  0.132252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  33.12 
 
 
278 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  28.57 
 
 
286 aa  53.1  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  32.69 
 
 
287 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.82 
 
 
297 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  28.67 
 
 
220 aa  53.1  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.56 
 
 
314 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  27.51 
 
 
243 aa  53.1  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.52 
 
 
280 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  21.67 
 
 
202 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.68 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  28.91 
 
 
282 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  29.86 
 
 
280 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  28.1 
 
 
282 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  32.37 
 
 
286 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  32.39 
 
 
280 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  28.1 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  28.1 
 
 
282 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  29.52 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  29.52 
 
 
236 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.74 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  28.1 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  28.57 
 
 
280 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  32.69 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  27.62 
 
 
280 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.13 
 
 
288 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.51 
 
 
302 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  29.2 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  32.04 
 
 
292 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  23.76 
 
 
202 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  34.71 
 
 
281 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  33.15 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  33.97 
 
 
257 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  32.05 
 
 
378 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.2 
 
 
314 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  32.33 
 
 
164 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.76 
 
 
298 aa  49.7  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  25.32 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  35.43 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  27.51 
 
 
200 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.88 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>