More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2699 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 		 381 aa  767    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  77.51 
 
 		 379 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  70.57 
 
 		 376 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  70.5 
 
 		 378 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  70.5 
 
 		 378 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  70.23 
 
 		 378 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  70.23 
 
 		 378 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  70.23 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  69.97 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  70.23 
 
 		 378 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  72.06 
 
 		 377 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  69.71 
 
 		 378 aa  541  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  70.94 
 
 		 389 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  69.07 
 
 		 380 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  69.07 
 
 		 380 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  72.06 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  71.02 
 
 		 377 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  71.8 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  71.8 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  70.76 
 
 		 377 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  67.54 
 
 		 374 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  70.76 
 
 		 377 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  66.23 
 
 		 374 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  65.78 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  64.17 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  64.72 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  63.86 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  63.14 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  66.75 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  64 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  57.92 
 
 		 389 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  60.32 
 
 		 384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  65.18 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  64.14 
 
 		 390 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  58.56 
 
 		 358 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  55.95 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  52.04 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  50.67 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  50.63 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  49.87 
 
 		 404 aa  352  8e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  52.91 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  50.53 
 
 		 382 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  50.4 
 
 		 386 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  45.52 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  60.47 
 
 		 89 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  30.34 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  28.93 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  30.36 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  30.64 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  34.68 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  25.14 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  30.64 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  30.64 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  31.76 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  32.17 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  30.1 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  28.85 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.81 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  34.38 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.67 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  36.52 
 
 		 345 aa  57  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  25.28 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  25.56 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.6 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  29.37 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.1 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  30.06 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.24 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  29.37 
 
 		 236 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  36.84 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  37.84 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  29.86 
 
 		 243 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.66 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.62 
 
 		 308 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  37.19 
 
 		 289 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  28.28 
 
 		 276 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  32.43 
 
 		 288 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  37.06 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  32.8 
 
 		 185 aa  53.9  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  37.89 
 
 		 249 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.79 
 
 		 280 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  29.85 
 
 		 234 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  30.52 
 
 		 264 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.41 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  33.85 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.15 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  27.04 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  36.96 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.95 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.22 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  23.33 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.48 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  34.56 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  35.71 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  34.67 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.58 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.84 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>