More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3159 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  85.53 
 
 		 380 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  758    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  85.53 
 
 		 380 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  78.51 
 
 		 389 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  76.19 
 
 		 378 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  75.93 
 
 		 378 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  75.66 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  75.93 
 
 		 378 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  75.93 
 
 		 378 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  75.4 
 
 		 425 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  75.66 
 
 		 378 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  78.25 
 
 		 377 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  77.45 
 
 		 377 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  75.93 
 
 		 378 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  76.39 
 
 		 397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  76.39 
 
 		 397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  76.66 
 
 		 397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  74.01 
 
 		 374 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  74.07 
 
 		 374 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  75.86 
 
 		 377 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  74.8 
 
 		 377 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  70.57 
 
 		 381 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  73.07 
 
 		 379 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  69.15 
 
 		 368 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  67.33 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  68.45 
 
 		 392 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  66.5 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  65.89 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  61.2 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  64.53 
 
 		 384 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  67.65 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  64.25 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  60.29 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  66.67 
 
 		 390 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  64.64 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  58.33 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  51.41 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  54.5 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  53.96 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  53.98 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  51.74 
 
 		 382 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  51.74 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  50.95 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  45.48 
 
 		 414 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  58.14 
 
 		 89 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 262 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  34.76 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  30.51 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  33.63 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  25.81 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.33 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  27.1 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.82 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  33.53 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  30.06 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  34.67 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  34.52 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.55 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.62 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  34.39 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  30.06 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33.76 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  30.06 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  36.9 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.64 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  24.73 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  24.6 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  30.16 
 
 		 280 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  35.98 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  30.92 
 
 		 227 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.34 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.42 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  30.67 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  34.91 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  32.12 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.48 
 
 		 284 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  35.15 
 
 		 280 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.34 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  32.48 
 
 		 234 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  37.27 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.55 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  33.81 
 
 		 275 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  35.54 
 
 		 278 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  39.76 
 
 		 286 aa  52.8  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  28.57 
 
 		 226 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  27.67 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  30.43 
 
 		 231 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  33.15 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  35.78 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  34.9 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1942  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.14 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.54 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.16 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  32.06 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  37.07 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  36.84 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  42.86 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.21 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.23 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>