More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0798 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  100 
 
 
286 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  99.65 
 
 
286 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  99.3 
 
 
286 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  94.76 
 
 
286 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  89.29 
 
 
282 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  90.36 
 
 
282 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  89.29 
 
 
282 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  89.64 
 
 
282 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  88.93 
 
 
282 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  77.9 
 
 
284 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  74.82 
 
 
284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  71.48 
 
 
280 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  72.73 
 
 
280 aa  424  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  73.4 
 
 
285 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  70.55 
 
 
280 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  69.82 
 
 
280 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  53.57 
 
 
284 aa  291  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  51.23 
 
 
288 aa  289  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  53.48 
 
 
279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.51 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.51 
 
 
277 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  52.51 
 
 
277 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  52.49 
 
 
286 aa  281  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  54.02 
 
 
285 aa  281  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  48.06 
 
 
285 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.26 
 
 
276 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.74 
 
 
277 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.35 
 
 
277 aa  278  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  51.35 
 
 
277 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.35 
 
 
277 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.35 
 
 
277 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.35 
 
 
277 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  51.06 
 
 
285 aa  275  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  52.69 
 
 
277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  51.09 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  50 
 
 
285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  53.64 
 
 
276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.33 
 
 
276 aa  271  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  49.28 
 
 
282 aa  268  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  50.57 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.92 
 
 
277 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.92 
 
 
277 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.92 
 
 
277 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.92 
 
 
277 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.92 
 
 
277 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.69 
 
 
276 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.5 
 
 
276 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.58 
 
 
276 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  48.74 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  53.91 
 
 
276 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50 
 
 
281 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.19 
 
 
276 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  53.91 
 
 
276 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.19 
 
 
276 aa  258  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.74 
 
 
276 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  51.65 
 
 
277 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  47.35 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.81 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  50.77 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  48.46 
 
 
283 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  45.99 
 
 
287 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  45.85 
 
 
287 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  45.85 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  45.76 
 
 
279 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  52.07 
 
 
276 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.59 
 
 
281 aa  238  1e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  45.65 
 
 
283 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  44.44 
 
 
274 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  42.91 
 
 
289 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  44.65 
 
 
301 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  43.43 
 
 
284 aa  228  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  46.03 
 
 
284 aa  225  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  44.57 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.23 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  43.08 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  42.29 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  40.77 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  39.64 
 
 
277 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  39.86 
 
 
305 aa  205  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  39.27 
 
 
277 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  42.22 
 
 
308 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  44.96 
 
 
286 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.09 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.15 
 
 
283 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.92 
 
 
280 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  41.31 
 
 
300 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.31 
 
 
300 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  40.94 
 
 
270 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  39.86 
 
 
289 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.11 
 
 
280 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  42.11 
 
 
280 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  42.11 
 
 
280 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.51 
 
 
283 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.06 
 
 
280 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  41.35 
 
 
280 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  37.99 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  42.26 
 
 
286 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.05 
 
 
286 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  40.68 
 
 
280 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  37.59 
 
 
281 aa  185  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>