More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2380 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  100 
 
 
382 aa  765    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2134  methyltransferase small  65.46 
 
 
418 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  56 
 
 
378 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0107  methyltransferase small  55.26 
 
 
374 aa  336  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  49.48 
 
 
394 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2646  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  51.05 
 
 
440 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11150  16S RNA G1207 methylase RsmC  46.33 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2508  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  45.61 
 
 
394 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.88 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3489  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.14 
 
 
384 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0711  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  27.97 
 
 
392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23400  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.86 
 
 
411 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.498455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1886  hypothetical protein  28.61 
 
 
416 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61090  hypothetical protein  35.97 
 
 
374 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.74 
 
 
382 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0751  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  35.64 
 
 
377 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5261  hypothetical protein  35.44 
 
 
374 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2886  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.42 
 
 
401 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5405  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.98 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002705  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  27.47 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.588026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  30.83 
 
 
378 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0790  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.07 
 
 
374 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.960699  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3376  methyltransferase family protein  30.83 
 
 
378 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2937  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.34 
 
 
383 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  30.57 
 
 
378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.57 
 
 
378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.57 
 
 
378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  30.57 
 
 
378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  30.57 
 
 
378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03277  16S RNA G1207 methylase RsmC  26.82 
 
 
385 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  30.31 
 
 
378 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07730  rRNA (guanine-N(2))-methyltransferase  34.44 
 
 
374 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3520  methyltransferase family protein  30.31 
 
 
378 aa  149  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4890  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.15 
 
 
374 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.81 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0753  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.25 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3407  methyltransferase family protein  30.08 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3481  methyltransferase family protein  30.08 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0536  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.47 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3411  methyltransferase family protein  29.82 
 
 
378 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3372  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4645  methyltransferase, putative  35.07 
 
 
374 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.56 
 
 
378 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0447  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.27 
 
 
384 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.389747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3515  methyltransferase family protein  29.82 
 
 
378 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000598825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4648  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.42 
 
 
374 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1097  hypothetical protein  30.83 
 
 
377 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3444  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.83 
 
 
378 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3577  methyltransferase family protein  29.55 
 
 
378 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.227162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0918  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.56 
 
 
378 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0934  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.19 
 
 
402 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4510  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.15 
 
 
374 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4279  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.44 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4312  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.21 
 
 
379 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3506  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.05 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0947  putative methyltransferase  26.15 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3380  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.32 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1941  methyltransferase small  34.35 
 
 
379 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0932  methyltransferase small  30.46 
 
 
377 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0562  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.68 
 
 
395 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0500  methyltransferase family protein  28.68 
 
 
395 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1094  methyltransferase family protein  28.68 
 
 
395 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0930  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.95 
 
 
377 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0968  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.59 
 
 
377 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3107  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.29 
 
 
424 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4642  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.7 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458952  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3436  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.99 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3101  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.08 
 
 
392 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3625  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.17 
 
 
419 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2217  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.02 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  30.97 
 
 
341 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  30.97 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  39.33 
 
 
332 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03670  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  27.27 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.37 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.43 
 
 
331 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  36.69 
 
 
331 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.42 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.28 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.42 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61220  hypothetical protein  38.82 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.527408  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.42 
 
 
332 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  28.57 
 
 
357 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0151  hypothetical protein  29.75 
 
 
340 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4712  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.83 
 
 
332 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0865771  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0597  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.53 
 
 
341 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.3 
 
 
347 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  36.09 
 
 
332 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2574  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C (16S rRNA m2G120 methyltransferase)  28.15 
 
 
353 aa  96.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.661981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  36.09 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4140  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.35 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.449195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  36.09 
 
 
343 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.09 
 
 
343 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  36.09 
 
 
343 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  36.09 
 
 
343 aa  94  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  36.09 
 
 
343 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  36.69 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  36.69 
 
 
342 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  36.69 
 
 
342 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  36.69 
 
 
342 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>