250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4312 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4312  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  100 
 
 
379 aa  787    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0562  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  71.66 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0500  methyltransferase family protein  71.66 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1094  methyltransferase family protein  71.66 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0536  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  67.11 
 
 
379 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0753  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  66.58 
 
 
379 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  64.81 
 
 
378 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  64.81 
 
 
378 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  64.81 
 
 
378 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3506  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  67.1 
 
 
385 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  64.81 
 
 
378 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3376  methyltransferase family protein  65.26 
 
 
378 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  64.81 
 
 
378 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  64.02 
 
 
378 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3520  methyltransferase family protein  64.29 
 
 
378 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  64.02 
 
 
378 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  63.3 
 
 
378 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3481  methyltransferase family protein  62.43 
 
 
378 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3407  methyltransferase family protein  62.17 
 
 
378 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3515  methyltransferase family protein  62.43 
 
 
378 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000598825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3577  methyltransferase family protein  62.17 
 
 
378 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.227162 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3411  methyltransferase family protein  62.17 
 
 
378 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3380  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  62.43 
 
 
380 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  45.89 
 
 
382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0447  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  47.91 
 
 
384 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.389747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0711  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  45.64 
 
 
392 aa  339  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03670  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  43.98 
 
 
410 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0947  putative methyltransferase  45.53 
 
 
382 aa  319  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3489  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  44.47 
 
 
384 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002705  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  45.31 
 
 
384 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.588026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03277  16S RNA G1207 methylase RsmC  45.69 
 
 
385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2937  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  45.45 
 
 
383 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5405  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  46.17 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1886  hypothetical protein  46.2 
 
 
416 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112919  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0968  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  44.65 
 
 
377 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0930  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  44.47 
 
 
377 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0934  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.95 
 
 
402 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3436  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.19 
 
 
412 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1097  hypothetical protein  43.39 
 
 
377 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0932  methyltransferase small  43.98 
 
 
377 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3107  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.19 
 
 
424 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3372  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.95 
 
 
378 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3101  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.75 
 
 
392 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61090  hypothetical protein  45.45 
 
 
374 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.95 
 
 
378 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0918  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.95 
 
 
378 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2886  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  42.12 
 
 
401 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5261  hypothetical protein  45.19 
 
 
374 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3444  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.95 
 
 
378 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4642  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  44.92 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458952  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07730  rRNA (guanine-N(2))-methyltransferase  43.24 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4648  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  44.65 
 
 
374 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4510  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  44.92 
 
 
374 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0790  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  44.53 
 
 
374 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.960699  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0751  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  45.11 
 
 
377 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4890  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  44.27 
 
 
374 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  44.3 
 
 
383 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3625  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  41.04 
 
 
419 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4279  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  42.78 
 
 
374 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4645  methyltransferase, putative  41.85 
 
 
374 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2217  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  39.11 
 
 
369 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1941  methyltransferase small  34.07 
 
 
379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  30.21 
 
 
382 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2134  methyltransferase small  28.35 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2508  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.26 
 
 
394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.87 
 
 
394 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  27.69 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.96 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.07 
 
 
331 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11150  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.37 
 
 
401 aa  103  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0597  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.55 
 
 
341 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0107  methyltransferase small  26.84 
 
 
374 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30 
 
 
342 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2977  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.69 
 
 
345 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2646  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.07 
 
 
440 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.55 
 
 
349 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4712  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.41 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0865771  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  28.17 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.15 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4140  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.37 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00279  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  26.37 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.08 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0687  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.56 
 
 
353 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3335  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.56 
 
 
353 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.533815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0831  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.31 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000982153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0806  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.31 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.56 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3530  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.31 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0838  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.31 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  34.29 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0671  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  28.09 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.08 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2574  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C (16S rRNA m2G120 methyltransferase)  25.9 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.661981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  26.37 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0151  hypothetical protein  27.46 
 
 
340 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3164  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.94 
 
 
347 aa  89.4  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30 
 
 
331 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  26.37 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.14 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3978  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.47 
 
 
343 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>